如果载有日本右翼分子的民间船只靠近独岛，韩国海警警备艇将根据应对指针紧急出动，并播放“侵犯领海将会拦截”的警告广播。如果日本船只进入独岛附近海域，韩方将通过用警备艇船身与其碰撞的“推挤”方式予以拦截，防止其靠近独岛。韩国海警在独岛近海部署了5000吨级“三峰号”和3000吨级“太平洋7号”等警备艇，可以拦截日本大型船只。

如果日本右翼分子登上独岛，韩国独岛警备队队员会将其逮捕，以违反《出入境管理法》的罪名将其“强行驱逐出境或进行审判”。

如果日本民间人士和船舶的规模大，或出动自卫队舰艇和飞机等军队设施，韩国军方会直接到一线进行应对。为应对这种情况，韩国军方于20世纪90年代初制定了独岛防御秘密计划《东方计划》，此后每年都和海警一起进行两、三次独岛防御演习“东方演习”。参与东方演习的包括海军的驱逐舰、巡逻舰、护卫舰、P-3C海上巡逻机和空军的F-15K和KF-16战斗机等，以及海军陆战队的约100名战士。